PLATEFORME DE GÉNOMIQUE MICROBIENNE DES SYSTÈMES ALIMENTAIRES

Cette plateforme est assurée par le Laboratoire de génomique microbienne de l’Université Laval, situé au Pavillon des services de la FSAA. L'équipe de ce laboratoire a développé une expertise pour le suivi des microorganismes présents dans la matrice alimentaire, notamment le lait et le fromage, à partir de leur ADN ou ARN. En complément aux méthodes de microbiologie classique qui peuvent s’avérer fastidieuses, les techniques de biologie moléculaire permettent des analyses plus poussées de la structure, de la diversité et de la dynamique des communautés microbiennes. La plateforme permet de réaliser des analyses génomiques basées sur le séquençage de gènes à haut débit, de méthodes de profilage et de PCR quantitative.

 

Un aperçu des techniques et équipements disponibles :


 

 

 

 

Responsable : Dr Denis Roy

Isolement et mise en culture de microorganismes alimentaires nécessitant des conditions particulières - Chambre à atmosphère contrôlée anaérobie et niveau de confinement 2

Lyse mécanique de cellules lors de l’extraction - Appareils d’homogénéisation

Assurance qualité - Spectomètre, fluriomètre et bioanalyseur

Quantification d’ADN génomique ou d’ADN complémentaire - Appareils de PCR en temps réel

Quantification exclusivement des bactéries vivantes avec une membrane intacte avec potentiel de viabilité et potentiel de culture - Appareil d’activation (LED-Active Blue system) pour le traitement au Propidium monoazide (PMA)

Identification des microorganismes présents dans les systèmes alimentaires - Séquenceur ABI 3130XL utilisant la méthode de Sanger

Exploitation de quantités massives de données métagénomiques issues du séquençage - Bio-informatique et biostatistiques avec logiciels performants

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450.773.8521 poste 8619

Faculté de médecine vétérinaire

3200 rue Scicotte

Saint-Hyacinthe (Qc) J2S 2M2

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